Текућа дезинфекција се спроводи током присуства индикација за преношење заразних болести и подразумева дезинфекцији површина и/или предмета на којима се могу наћи секрети и ексекрети болесника или клицоноше. Дезинфекцију је потребно отпочети што раније, одмах по откривању заразне болести и спроводити свакодневно до излечења оболелог. Циљ текуће дезинфекције је спречавање и сузбијање ширења заразних болести.